Pflanzlicher Jogurt wird im Prinzip genauso hergestellt wie jener aus Milch. Das heißt, dass man dabei Milch fermentiert. Für die vegane Alternative wird darauf geachtet, dass man pflanzliche Milch (z. B. Mandel- oder Sojamilch) und vegane Jogurtbakterien verwendet. Damit die Bakterien auch wirklich vegan sind, müssen sie auf einem veganen Nährboden gezüchtet werden.
Für die Herstellung wird die pflanzliche Milch erhitzt und die Jogurtbakterien werden hinzugefügt. Hier werden entweder eine kleine Menge bereits fertigen, veganen Jogurts oder seperat gekaufte Jogurtkulturen verwendet. Diese verwandeln die Milch nach und nach in Jogurt – vorausgesetzt, die Mischung wird an einem warmen Ort wie einer Heizung oder einem Ofen gelagert. Der ganze Prozess dauert nicht länger als ein paar Stunden, wenn man bereits fertigen Jogurt verwendet hat. Bei unentwickelten Jogurtkulturen muss benötigt man mehr als einen halben Tag Zeit.